在冰河期海面較低而出現陸橋時，“古蒙古利亞人”（廣泛分布于東南亞）之一部，從中國大陸南部移居到沖繩和西日本，形成了“原日本人”，他們便是繩紋時代日本人的母體。

自繩紋時代晚期開始，又有亞洲大陸移民進入日本，到彌生時代，大陸移民急劇增加。

經許多學者研究，認為彌生時代的大陸移民，來自朝鮮半島和中國東北，蒙古東西伯利亞等東北亞地區，屬“新蒙古利亞人”系統，最初居住于本州西端和北九州，以后逐漸向東擴散，經近畿地區擴散至關東地區。

在這個時代，有許多中國江南地區的移民，直接或經南島地區進入日本。

在擴散過程中，他們不斷與原居民混血。

彌生時代后的古墳時代（3世紀至6世紀），大陸移民仍不斷進入口本，且繼續向東日本扣各地擴散，與原居民的混血亦持續進行。

也就是在這一時期，秦始皇派徐福率三千童男童女東渡日本，并留在了那里，為日全人留下了種。

當時的日本，彈丸之地，卻有上百國之多，如果放在中國，那些個所謂的國家，也就是一群土地主而已。

中國正史《漢書·地理志》記載說：“樂浪海中有倭人，分為百余國，以歲時來獻見云。”

其中的“百余國”，雖非確數，但也反映了公元前2世紀至公元1世紀這一時期，在日本列島小國林立的狀況。